Die Anfänge der Protestanten in Lyon ist verzweigt und verbunden mit dem Ablauf der Stadt selbst. Im 16. Epoche erlebte Lyon eine Aufschwung des Calvinismus, wobei zahlreiche Händler und geistige Persönlichkeiten sich dem neuen Bekenntnis zuwandten. Diese anfängliche Präsenz führte zu einer dynamischen reformierten Gemeinschaft, die jedoch au